De monumenten in Nederland die door het Rijk zijn aangewezen als beschermd monument zijn opgenomen in het Rijksmonumentenregister. Rijksmonumenten zijn van nationale betekenis. Bijna alle rijks beschermde monumenten zijn in particulier bezit.
Op het Janskerkhof staan ruim vijftig monumenten die in het Rijksmonumentenregister zijn opgenomen.
Daarnaast kent het Janskerkhof een aantal gemeentelijke monumenten en panden die tot het beschermd stadsgezicht behoren.
Janskerkhof 11 te Utrecht (tot 1890: wijk G no. 241) wordt in het Rijksmonumentenregister omschreven als: “Pand met pilastergevel met grote orde en rechte kroonlijst, gedekt door schilddak, omstreeks 1650.” Het huis werd in 1663 gebouwd door metselaar Gijsbert Anthonisz van Vianen.
Aan de zuidkant van de Janskerk is in de zeventiende eeuw een dwars huis tegen de kerk aangebouwd. In het Rijksmonumentenregister staat het huis vermeld onder de huisnummers 27 en 28, beide met de omschrijving: “Huis onder rechte kroonlijst tegen de Janskerk gebouwd, XVIII”.
Janskerkhof 3 Utrecht was oorspronkelijk deel van het Minrebroedersklooster uit 1246. In 1581 werd een groot deel van het klooster afgebroken. De refter werd in gebruik genomen als Statenkamer. Sinds 1816 is het pand in gebruik bij de Universiteit Utrecht.
Janskerkhof 2 te Utrecht (tot 1890: wijk G no. 250) wordt in het Rijksmonumentenregister omschreven als: “Ridderschapshuis. Sobere gevel met rechte kroonlijst XVIII.”
Janskerkhof 1 (tot 1890: wijk G no. 249) wordt in het Rijksmonumentenregister omschreven als: “Statig herenhuis met rechte kroonlijst XIX.” Volgens M. Dolfin e.a. is het huis gebouwd in de zeventiende eeuw en vervolgens in de late achttiende eeuw verbouwd. Het is een dwars huis met achterhuis, bestaande uit twee bouwlagen en een zadeldak.
Janskerkhof 24 te Utrecht (tot 1890: wijk G no. 230) wordt in het Rijksmonumentenregister omschreven als een pand met lijstgevel. Het is een in oorsprong middeleeuws dwars huis met twee diepe achterhuizen.
Janskerkhof 21 stamt vermoedelijk uit de zeventiende eeuw. Op het perceel Janskerkhof 21 stonden in die tijd twee huizen naast elkaar. De huizen werden tot 1745 als huurwoningen gebruikt. Janskerkhof 21 dankt zijn achttiende-eeuwse uiterlijk aan een ingrijpende verbouwing tussen 1745 en 1749, waarbij de huizen werden samengevoegd tot een huis en de gevel werd vernieuwd.
Janskerkhof 20 te Utrecht (tot 1890: wijk G no. 234) wordt in het Rijksmonumentenregister omschreven als een huis “met gepleisterde lijstgevel XIX aanzien, doch van oudere oorsprong”. Het huis is voortgekomen uit een koetshuis en stal die hier tot in de tweede helft van de negentiende eeuw hebben gestaan en lange tijd hoorden bij het huis op Janskerkhof 15a.
Janskerkhof 19 Utrecht (tot 1890: wijk H no. 591) wordt in het Rijksmonumentenregister omschreven als: “Statig herenhuis met langgerekte bepleisterde gevel, rechte kroonlijst, zakgoot en dubbele topgevel.”
Janskerkhof 18 Utrecht is in oorsprong een claustraal huis, dat in de middeleeuwen binnen de immuniteit van het kapittel van St. Jan stond. Daarom is het huis terugliggend ten opzichte van de rooilijn.
Janskerkhof 15a Utrecht werd rond 1662 gebouwd voor oud-burgemeester Johan van Nellesteyn. Bij een verbouwing in de negentiende eeuw kreeg het huis de voordeur in de Boothstraat. In de jaren dertig van de twintigste eeuw kreeg het huis weer een voordeur aan het Janskerkhof.
Janskerkhof 15 Utrecht (tot 1890: wijk H no. 608) wordt in het Rijksmonumentenregister omschreven als: “Statig herenhuis met rechte gemetselde kroonlijst, omtrent 1660. Horizontale zandstenen dekplaten boven de vensters.”
In 1897 kocht het Utrechtsch Studenten Corps (USC) het 17e-eeuwse huis Janskerkhof 14. Het huis werd afgebroken om ruimte te maken voor de bouw van een studentensociëteit.
Janskerkhof 13a te Utrecht (tot 1890: wijk H no. 610) wordt in het Rijksmonumentenregister omschreven als: “Statig huis met rechte kroonlijst. Aanvang XIX.” De geschiedenis van het huis is verbonden met die van Janskerkhof 13.
De Janskerk wordt in het Rijksmonumentenregister als volgt omschreven: “Janskerk. Tufstenen kruiskerk door Bisschop Bernulphus gesticht tussen 1048-’54, het koor van 1539, westgevel waar vroeger twee torens stonden van 1682, o. kapel 1536, w. kapel thans hoofdwacht zie aldaar. Kerkekamer met goudleder 1755. Graftombe van de proost van Wassenaar. Orgel met Hoofdwerk, Bovenwerk en vrij Pedaal, in 1861 gemaakt door C.G.F. Witte.”